Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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