Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPD1P17405 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms