Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODC1P11926 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODC1P11926 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms