Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RALAP11233 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RALAP11233 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RALAP11233 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RALAP11233 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RALAP11233 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RALAP11233 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RALAP11233 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RALAP11233 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms