Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLTAP09496 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLTAP09496 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLTAP09496 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLTAP09496 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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