Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI1P08151 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI1P08151 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI1P08151 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI1P08151 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms