Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms