Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXTL3O43909 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms