Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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