Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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