Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CCDC78A2IDD5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCDC78A2IDD5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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