Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UTP11Q9Y3A2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms