Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPA4Q9UI42 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms