Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC180Q9P1Z9 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms