Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms