Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms