Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM106CQ9BVX2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms