Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms