Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP88Q99567 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NUP88Q99567 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms