Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms