Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC71Q8N4P6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms