Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms