Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms