Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms