Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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