Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms