Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms