Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms