Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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USP46P62068 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP46P62068 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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USP46P62068 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP46P62068 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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