Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB9AP51151 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB9AP51151 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB9AP51151 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB9AP51151 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB9AP51151 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB9AP51151 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB9AP51151 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB9AP51151 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB9AP51151 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RAB9AP51151 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB9AP51151 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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