Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRXP46100 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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