Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETFBP38117 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETFBP38117 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms