Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5C1P36542 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5C1P36542 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5C1P36542 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5C1P36542 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.6 ms