Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASQ1P31415 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CASQ1P31415 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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