Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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