Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRCP23327 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HRCP23327 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms