Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGFR4P22455 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR4P22455 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms