Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms