Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEBLO76041 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEBLO76041 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms