Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GIPC1O14908 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC1O14908 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GIPC1O14908 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms