Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
O00370 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
O00370 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
O00370 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
O00370 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
O00370 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
O00370 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
O00370 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
O00370 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
O00370 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms