Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms