Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C4orf47A7E2U8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C4orf47A7E2U8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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C4orf47A7E2U8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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C4orf47A7E2U8 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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C4orf47A7E2U8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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C4orf47A7E2U8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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C4orf47A7E2U8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C4orf47A7E2U8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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