Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRD1A4D1F6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms