Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms