Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms