Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms