Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms