Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPJQ9HC77 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPJQ9HC77 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPJQ9HC77 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPJQ9HC77 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPJQ9HC77 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPJQ9HC77 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms