Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BBS2Q9BXC9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms